Боротьба Кіпру за вступ до Шенгенської зони є не лише виконанням зобов’язань ЄС, а й стратегічним кроком, що може призвести до ескалації регіонального конфлікту. Поширення Шенгенських стандартів лише на контрольовані урядом території Кіпру трансформує Зелену лінію в жорсткий європейський кордон, що може викликати гостру реакцію Анкари.

Відмінність між європейською централізацією і потребами бінціональної федерації Кіпру створює серйозні структурні протиріччя. Туреччина, сприймаючи ініціативу як загрозу своїм інтересам, здатна застосувати військові та політичні заходи, включаючи посилення військової присутності в північній частині острова і блокування співпраці ЄС та НАТО.

При цьому довготривала нестабільність загрожує економіці Кіпру, особливо сфері туризму, офшорним фінансам та судноплавній галузі. Республіка Кіпр може бути змушена змінити свій відкритий економічний профіль на суворо контрольовану оборонну базу Європи.